SSR分子标记技术及其在蓖麻研究中的应用研究进展
时间：2021-01-24 20:05:08 来源：雅意学习网 本文已影响 人 
摘要 本文介绍了简单重复序列（simple sequence repeat，SSR）分子标记的原理及优点，综述了该技术在植物遗传多样性、种质资源鉴定、杂交种纯度鉴定以及蓖麻研究中的应用，并展望了DNA分子标记技术在蓖麻遗传育种上的应用前景，以期为SSR分子标记的研究与应用提供参考。
关键词 DNA分子标记；SSR；蓖麻；研究进展
中图分类号 S565.6 文献标识码 A 文章编号 1007-5739（2017）23-0016-01
Abstract In the paper，the principle and characteristics of the DNA molecular marker techniques of simple sequence repeat（SSR）were described. The research of the technique in the fields such as genetic polymorphism analysis，germplasm resources，hybrids purity identification and application on castor were summarized. The application prospect of DNA molecular marker technology in castor was put forward，with the purpose of offering references to research and application of castor.
Key words DNA molecular marker；SSR；castor；research advance
蓖麻（Ricinus communis L.）为大戟科蓖麻属草本植物，是十大油料作物之一。蓖麻的应用领域广泛，蓖麻叶可用于养蚕，蓖麻毒素具有抗癌功效，蓖麻粕是优质绿色肥料，蓖麻油的衍生物逾170种，被广泛应用于纺织、印染、医药、制造等领域[1]。
DNA分子标记是指能够直接反映不同生物个体或种群基因组间差异特征的DNA片段，是基于DNA分子的多态性建立起来的一类标记方法。简单序列重复（simple sequence repeat，SSR）又称微卫星（microsatellite），为DNA分子标记的一种，指在真核生物整个基因组中存在序列较短且重复出现的核苷酸序列，一般由2～6个核苷酸组成1个重复单位。SSR标记技术具有以下优点：一是微卫星寡核苷酸重复次数在同一物种不同個体基因型间差异很大，呈现高度多态性；二是共显性遗传，符合孟德尔遗传规律，可鉴别纯合子和杂合子；三是所需DNA质量要求不高，且量少；四是实验重复性好，结果稳定可靠[2]。
1 SSR分子标记技术在植物遗传研究中的应用
1.1 遗传多样性分析
遗传多样性是生物多样性的重要组成部分，指种内个体之间或一个群体内不同个体的遗传变异总和。对植物遗传多样性的研究能够为其分类、进化提供理论资料，为植物的育种和遗传改良奠定基础。
王丽鸳等[3]用48对具有多态性位点SSR引物对91份浙江省地方茶树品种龙井种的遗传多样性进行了分析，共扩增出171个等位基因，285个基因型，Shannon多样性指数为0.871 3，观察杂合度为0.440 9，表明48对引物在茶树上多态性较高；黄 玮等[4]利用305对多态性SSR引物检测了18个彩色小麦品种（系），共检测到1084个等位变异，平均每对引物检测到3.6个。UPGMA聚类分析揭示了18个彩色小麦品种（系）明显的遗传差异；李为民等[5]利用10对SSR引物分析了濒危植物秦岭冷杉6个自然居群的120个个体的遗传多样性，共检测到149个等位基因，数据分析表明，秦岭冷杉自然居群的遗传多样性水平较低，遗传变异主要存在于居群内部。
1.2 种质资源鉴定
种质资源是新品种选育的基础，通常种质资源鉴定是根据其农艺性状加以区分，但是随着登记品种数量不断增加，此方法已变得十分困难。利用SSR分子标记构建的指纹图谱可以有效鉴定不同品种。
段艳凤等[6]利用筛选出的10对SSR引物分析了中国88个马铃薯审定品种的多态性，结合PIC值，选出S180、S25、S7、S151、S184和S192共6对引物构建了88份供试材料的指纹图谱，为马铃薯品种鉴别、优良杂交组合选配提供了分子水平上的依据；陈 坚等[7]的研究中，采用6对SSR引物可将9个紫云英品种完全区分开，并且这6个位点在9个品种中形成较高的多态性指数，说明SSR位点可以从分子水平揭示现有紫云英推广品种基因型的不同，为该品种鉴定和保护提供了可靠工具；雷云霆等[8]利用从老芒麦（Elymus sibiricus）自身基因组中开发出来的6对多态性SSR引物对3个老芒麦牧草品种和7个种质进行了指纹图谱鉴别研究，结果表明，这6对SSR引物在10个品种或种质中多态性丰富，3对引物组合就可以将10个材料完全分开。
1.3 杂交种纯度鉴定
杂交种田间鉴定通常需要在特定的种植季节进行，并且易受季节、环境及人为因素影响，而应用SSR分子标记技术具有鉴定时间短、准确性高、不受环境等因素影响的优点。
赵欣欣等[9]用4对引物对5个多花黑麦草杂交组合150份杂交后代进行鉴定，结果表明，杂交后代在任意1对引物扩增后均具有1条或多条父本特征带，150份杂交后代中有108份真杂交种；车 卓等[10]从20对SSR引物中筛选出2对引物bnlg2291k4和bnlg2305k4，用于玉米杂交种吉祥1号的纯度鉴定，结果表明，选用的2对引物均能明显地区分亲本和杂交种，试验中人为地在吉祥1号杂交种中混入双亲，这2对引物仍然能准确地鉴定出混入的自交系；卢 虹等[11]利用3对SSR引物检测了188个甘蓝型油菜杂交种陕油16 F1代单株，PCR扩增结果显示，检测的单株均具有亲本的2个特异性条带，说明SSR标记有稳定的共显性，分子标记鉴定的结果表明，SSR标记技术得到的纯度鉴定结果比种植鉴定更可靠、准确。
